Kursusbeskrivelse:

Udviklinger af molekylærmedicinske analysemetoder går stadig stærkt. En naturlig udvikling er at mange ”håndanalyser” i dag erstattes med moderne analyseapparater. Den baggrundsviden der ligger til grund for disse nye analysemetoder og analyseapparater belyses på kurset, både teoretisk og ved praktiske øvelser.
Kurset er bygget op omkring de praktiske øvelser, hvor Polymerase Chain Reaction - PCR – anvendes dels til screening og diagnostik af genmutationer og DNA – sekventering, og dels til cDNA syntese - fra oprenset total RNA fra celler - med efterfølgende kvantitering af udtrykt mRNA – QPCR.
Analysemaskinerne der bruges til screening er en nyudviklet Light Scanner fra Idaho Technology som efter PCR med indbygget LC Green, identificerer forskellige DNAstrenges smeltetemperaturprofil.
Til mutationsdetektion sammenlignes restriktionskløvning af PCRprodukter med automatiseret TaqMan SNP detektionsassay på ABI 7000 fra Applied Biosystems. Denne maskine bruges også til kvantiteringen af RNA, mens DNA sekventeringen udføres efter PCR på ABI Avant 3100 fra Applied Biosystem– vha. kapillærelektroforese.
De teoretiske forelæsninger - som fortrinsvis vil være teknik orienteret – vil blive placeret i begyndelsen og slutningen af kurset. Desuden vil kursisterne blive opfordret til, med korte indlæg, at fortælle om deres arbejdsområde.
Hvordan DNA og mutationsdatabaserne anvendes demonstreres både teoretisk og ved praktiske øvelser. Desuden vil der være øvelser i at designe primere til PCR vha. computerprogram.
Til laboratorieøvelser deles kursisterne i grupper, som udfører øvelserne. Der vil til hver af øvelserne være en vejleder tilstede under hele kurset.

Indhold:
Teori:
• Hvad er molekylær medicin, cellebiologi, arvelige sygdomme.
• Optimering af PCR - DNAsekventering.
• Kvantitering af RNA QPCR.
• Mutationsopsporing og detektion af sygdomsfremkaldende mutationer.
• Opsporing af sygdomsgener.

Øvelser:
• Mutationsscreening.
• Mutationsassay – restriktionskløvning og automatiseret analyse vha. TaqMan prober.
• Sekventering af PCR produkter.
• Isolering af RNA.
• Kvantitering af RNA.
• Databasesøgning.
• Deltageroplæg.

Målgruppe:
Bioanalytikere eller andet laboratoriepersonale, som har kendskab til DNA- RNA arbejde eller tidligere har deltaget i kurser om grundlæggende genteknologi.

Undervisere:
Lektor Brage Storstein Andresen.
Lektor Claus Lindbjerg Andersen.
Professor Niels Gregersen.
Adjunkt Rikke Olsen.
Afdelingsbioanalytiker Vibeke Stenbroen.

Kursusleder:
Afdelingsbioanalytiker Vibeke Stenbroen.